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安理汇||文献分享 塞内加谷病毒3C蛋白酶是一种猪特异性IL-1β转化酶

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【文献摘要】  2024年7月,中国农业大学等单位的相关研究人员在《PLOS PATHOGENS》(IF: 6.7)上发表了题为“Species-specific IL-1β is an inflammatory sensor of Seneca Valley Virus 3C Protease”的研究论文,报导了塞内加谷病毒3C蛋白酶是一种猪特异性IL-1β转化酶,为病毒感染中的炎症反应机制提供了新的视角。

 

亮点概述

●SVV 3C蛋白酶的独特功能:发现SVV 3C能够直接切割猪Pro-IL-1β,生成活性cIL-1β,展示其作为炎症传感器的独特性。

●生物活性确认:生成的cIL-1β能够与猪IL-1R1结合并引发促炎反应,说明其具有生物活性,对宿主免疫反应有重要影响。

● 结构模型的建立:通过结构模型分析,确定了sPro-IL-1β前结构域在切割中的关键角色,为进一步研究提供了基础。

● 新颖的炎症激活途径:揭示SVV 3C在炎性小体途径被抑制的情况下仍能激活IL-1β,为病毒感染中的炎症反应机制提供了新的视角。

 

值得关注

     在这篇研究中,研究人员使用了安理科技公司的Falcon S300全自动归一化分析系统,对细胞进行了明场及绿色荧光图像采集和分析。该系统具有高对比度相差成像以及蓝、绿双色荧光通道成像功能,配合智能化的CellsMeta控制分析软件,可快速获得高清晰度高质量全孔细胞图像,并自动得到细胞计数、细胞汇合度、细胞转染效率、免疫荧光检测、活性氧检测等数据结果。

     Falcon S300采用10×WICA技术,即10倍物镜全孔原位细胞成像与分析技术,使得全球科学家可以高效、完美地获取整板全孔细胞图像和数据,快速实现细胞实验原始数据的归一化。由于该系统采用箱体封闭设计,自带暗室,体积小巧,节省空间 适合放置于细胞培养间内或直接放置于超净工作台内使用,让我们的细胞实验、尤其是细胞能量代谢实验更准确、更便捷。

Falcon S300在细胞实验中的应用:

●1.细胞计数

  a.无标记、无破坏性、无需胰酶消化的贴壁细胞计数。

  b.荧光计数。

  c.细胞板计数。

  d.血球计数板。

●2.细胞汇合度

  Falcon S300可以为汇合度检测提供统一的分析标准。

●3.相差荧光成像

  a.细胞转染实验

  b.细胞活性氧(ROS)检测

  c.细胞免疫荧光检测

●4.Seahorse细胞分析

  应用场景一:摸索细胞接种密度,降低Seahorse实验成本,

  应用场景二:确定最佳上机时间,70%-90%汇合度最为适宜,

  应用场景三:换液后,利用脱气时间,检测全孔细胞形态和汇合度确定是否继续进行上机实验。

  应用场景四:细胞归一化:Seahorse下机后,直接进行全孔原位细胞成像和计数分析,一键式实现数据归一化。

 

 
研究背景

       炎症小体在炎症中发挥关键作用,通过加工和促进IL-1β的分泌。Caspase-1参与IL-1β和IL-18的成熟,而人类caspase-4特异性加工IL-18。最近对与Pro-IL-18结合的caspase-4的结构研究揭示了其激活机制。然而,caspase-1加工pro-IL-1β及其他IL-1β转换酶的机制仍不清楚。

       IL-1β是关键的炎症介质,对于免疫反应和病理性炎症至关重要。大规模复合体通过NOD样受体组装后,caspase-1作为内源性酶切割Pro-IL-1β以激活IL-1β。先前的研究已确定IL-1β是A组链球菌(GAS)蛋白酶SpeB的先天免疫传感器。然而,IL-1β是否为病毒蛋白酶的炎症传感器仍不清楚。

 

引言

      NOD样受体(NLRs)通过感知病原体相关分子模式或危险信号来检测病毒入侵,并通过经典的炎症小体激活caspase-1。激活后,caspase-1切割Pro-IL-1β和Pro-IL-18,这两者作为无活性的细胞质前体存在,其N端区域需要被切割才能变得具有生物活性。一旦从活细胞释放到细胞外空间,或者通过一种称为焦亡的裂解性细胞死亡形式释放,IL-1β和IL-18就会结合到邻近细胞上的炎症诱导受体,诱导强烈的炎症反应。因此,IL-1β和IL-18成熟的调控因其在先天免疫中的关键角色而越来越受到关注。

      caspase-1对IL-1β的激活受到两级调控系统的严格控制,包括NLRP3的激活和caspase-1的自我蛋白水解。除了caspase-1的精确调控,致病细菌酶如SpeB和LasB也能直接切割Pro-IL-1β生成生物活性的IL-1β,从而引发宿主炎症相关疾病。然而,目前尚不清楚病毒酶是否能作为IL-1β转换酶(ICE)来切割Pro-IL-1β。ICE对Pro-IL-1β的切割和激活的分子机制也并不清晰。在本研究中,作者观察到小RNA病毒SVV 3C蛋白酶是一种新型的ICE,选择性切割猪Pro-IL-1β的寡聚前体,生成成熟的单体IL-1β(cIL-1β)。这种切割后的IL-1β具有生物活性,促使猪肺泡巨噬细胞(PAMs)启动强烈的炎症反应,从而抑制病毒复制。

 

结果与讨论

1. SVV感染引发IL-1β表达

SVV感染导致猪PAM细胞中IL-1β的mRNA和蛋白质水平显著升高,且与EMCV组相比,SVV组的细胞死亡率也更高,表明SVV感染引发更强的炎症反应。

2. SVV 3C蛋白酶的功能

       SVV 3C蛋白酶被发现能够直接切割sPro-IL-1β,形成活性cIL-1β,这一过程不依赖于NLRP3炎性小体或胱天蛋白酶。研究显示SVV 3C在特定的“LQ”基序处切割sPro-IL-1β,且这一切割机制与其他病毒的蛋白酶不同。在SVV感染的细胞中,检测到cIL-1β的产生与释放,且这一释放在感染后的6至16小时内达到高峰,显示SVV能够有效诱导IL-1β的切割和分泌。
3. SVV 3C的催化活性
      通过突变实验确认SVV 3C的催化活性对sPro-IL-1β的切割至关重要。特定氨基酸突变导致切割活性显著降低,进一步验证了SVV 3C作为IL-1β转化酶的独特性。SVV 3C蛋白酶切割sPro-IL-1β不仅依赖于“LQ”基序,还需要独特的前结构域。该结构域的关键残基(90-115)对SVV 3C的识别和切割至关重要,而人类Pro-IL-1β的相应区域则形成了打结结构,阻止了切割。通过AlphaFold构建了sPro-IL-1β与SVV 3C的复合物模型,确认了残基109-114在切割中的重要性。缺失突变实验进一步支持了这一发现,显示删除残基90-115会阻止SVV 3C的切割。
4. cIL-1β的活性
      SVV 3C切割生成的cIL-1β具有生物活性,能与受体IL-1R1结合,并激活炎症反应。体外实验表明,cIL-1β能够显著提高IL-1β、IL-6和TNF-α的mRNA水平,且在抑制SVV复制方面表现出与成熟IL-1β相似的效果。cIL-1β显著抑制SVV的复制,通过TCID50分析确认其降低病毒滴度的能力。这些结果表明SVV 3C的切割产物cIL-1β在病毒感染中发挥了重要的抑制作用。

 

     IL-1家族细胞因子的主要功能是在病原体相关分子模式(PAMPs)或损伤相关分子模式(DAMPs)刺激下调节促炎反应。在病毒感染期间,病毒通过分泌促炎细胞因子,特别是IL-1β,来协调炎症反应。IL-1β最初以无活性前体(Pro-IL-1β)形式产生,并通过一系列蛋白酶(如caspase-1、中性粒细胞来源的蛋白酶和微生物来源的蛋白酶)转化为其活性形式。      

       作者的结果表明,Pro-IL-1β作为SVV 3C蛋白酶的炎症传感器,从而启动炎症激活。SVV 3C选择性切割sPro-IL-1β而不影响hPro-IL-1β,并且不切割Pro-IL-18或Pro-IL-33,显示出底物特异性的相互作用。虽然3C蛋白酶是小RNA病毒科病毒的共同特征,但本研究显示该科中的其他3C蛋白酶不切割Pro-IL-1β。在SVV感染的背景下,炎症小体的激活和SVV 3C对Pro-IL-1β的直接切割同时发生。然而,当炎症小体被全caspase抑制剂阻断时,SVV 3C仍通过直接切割激活IL-1β,作为诱发炎症反应的替代途径。扩展对其他病毒3C样蛋白酶的研究得出令人惊讶的结果:没有一种能够切割Pro-IL-1β。这一特异性表明SVV 3C是目前唯一能够切割Pro-IL-1β的病毒蛋白酶,这也解释了SVV感染为何引起更强的炎症反应。

       IL-1β在宿主-病原体相互作用中发挥关键作用,尤其在病理损伤中。在细菌感染中,来自链球菌和铜绿假单胞菌的蛋白酶能够直接切割Pro-IL-1β,提供了新见解,说明细菌感染如何导致宿主高炎症和脓液形成。通常,经典炎症小体通路被认为是病毒感染时激活IL-1β的机制。然而,作者的发现表明SVV 3C蛋白酶也能直接切割Pro-IL-1β产生IL-1β,尤其是在经典炎症小体通路受到抑制时。

 

      总之,本研究表明猪Pro-IL-1β是一种炎症传感器,能够通过与宿主炎症小体并行的独立通路直接检测SVV 3C蛋白酶。尽管猪和人类的Pro-IL-1β具有高度序列同源性,但猪Pro-IL-1β前体的独特结构导致SVV 3C对底物的识别。然而,需要进一步的结构研究来展示猪Pro-IL-1β的寡聚化过程以及SVV 3C蛋白酶如何识别底物。本研究中阐明的猪IL-1β成熟的独特机制为IL-1β的加工和激活提供了宝贵的见解,推进了我们对先天免疫的理解。

 


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2024年10月23日 14:46
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